 蛋白质组学介绍 蛋白质组（Proteome）是指基因组表达的所有相应蛋白质的集合，即细胞、组织或机体全部蛋白质的存在及其活动方式。蛋白质组学（Proteomics）是指利用高分辨的蛋白质分离技术和高效的蛋白质鉴定技术在蛋白质水平上整体性、动态和定量地研究生命现象及规律的科学，是系统生物学的有机组成部分。 蛋白质组是空间和时间上动态变化着的整体，一个基因组对应多个蛋白质组。相比稳定的基因组，蛋白质组是遗传信息、环境因素、生活习惯等多因素的综合体现。同一细胞/组织，在不同时间/不同环境条件下蛋白谱的表达也存在不同。如上图所示：线粒体呼吸链酶家族的蛋白表达水平不仅在不同成人器官中存在显著差异，同样在心脏中，胎儿与成人蛋白表达量也差异巨大。因此，蛋白质组是最能实时反映细胞/组织功能和疾病发生状态的一类分子，也是疾病发生最相关的分子类型，具有广阔研究前景。 蛋白质组学定性原理 基于LC-MS/MS技术的蛋白质组定量技术一般分为标记法和非标记法两种类型。目前常用的标记法有：iTRAQ（体外）、TMT（体外）、SILAC（体内）三种基于同位素标签进行半定量的方法。以常用的iTRAQ蛋白质组学定量为例（如下图）：iTRAQ是由8种（113/114/115/116/117/118/119/121）同位素标签组成，在实验过程中将8例不同样品分别酶解成多肽片段→分别标记8种同位素标签→将8例标记好的多肽样品混合成1例总样品→进入LC-MS/MS分析系统→二级MS阶段iTRAQ平衡基团发生中性丢失，在低质量区产生多个报告离子→计算各报告离子峰面积，获得同一肽段不同样品间的相对丰度差异比值→加权计算肽段丰度获得总蛋白质相对定量值。
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2023-10-20
杂志名称：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research影响因子：12.658文章：Procoxacin bidirectionally inhibits osteoblastic and osteoclastic activity in bone and suppresses bone metastasis of prostate ca...
2023-10-20
小分子靶标发现策略01引言药物研发是医学领域的重要研究方向，而药物靶点的发现是药物研发的关键步骤。传统的药物研发方法面临着许多挑战，如研发周期长、研发成本高、药物疗效不理想等。为了解决这些问题，基于化学修饰技术的药物靶点发现研究应运而生。这种技术通过将药物分子进行化学修饰，并与固相载体微球表面的活性反应基团相互作用，将药物分子偶联到微球表面。然后，将微球与细胞裂解液混合，使微球表面的药物分子...
2023-09-13
转自凌恩生物蛋白质组学指的是在不断变化的生物条件下定量测量蛋白质组的表达。液相色谱与结合串联质谱(LC-MS/MS)的蛋白质组学技术，在硬件和软件的快速发展的推动下，已将蛋白质组学转变为能够在一天内测量数百个样本的高通量实验过程。但是还是有很多老师不太懂如何选择这些技术，我师妹就遇到了这类问题：下面就由大师姐给我们介绍一下这几个技术和优缺点吧~1Label-free技术 Label...
2023-08-15
磷酸化蛋白研究 So Easy！蛋白磷酸化 蛋白质磷酸化是研究最多的翻译后修饰 (PTM)，其中来自三磷酸腺苷 (ATP) 的磷酸基团共价连接到丝氨酸 (~86%)、苏氨酸 (~12%) 或酪氨酸 (~2 %) 被激酶去除并被磷酸酶去除。磷酸化可以改变蛋白质的结构、功能和相互作用。因此，磷酸化在体内平衡和疾病的几乎所有细胞过程中都起着至关重要的作用，包括信号转导、细胞周期、分化、增殖、...
2021-12-03
三阴性乳腺癌（Triple-Negative Breast Cancer, TNBC）指雌激素受体 (Estrogen Receptor, ER)、孕激素受体 (Progesterone Receptor, PR)、人表皮生长因子受体-2 (Human Epidermal Growth Factor Receptor 2, HER-2)表达均为阴性的一类乳腺癌，约占浸润性乳腺癌病例的15-2...
2021-12-03
为发现血浆中与免疫抑制剂治疗相关的系统性变化，并寻找与治疗结果相关的潜在生物标志物，瑞典卡罗琳斯卡医学院 (Karolinska Institute) 的研究人员借助基于Olink的靶向蛋白质组学（Olink I/O Panel）及其他方法分析了24名CM患者的连续血浆样本，并同时分析了24名接受MAPKis治疗CM患者的血浆蛋白组以确定ICI治疗的特异性血浆蛋白水平的变化；相关结果发表在J...
2021-12-03
概述: 心房颤动（AF）是造成心律失常或心律紊乱的最常见原因之一。AF患者更有可能出现血栓和患中风，然而这种严重的病症往往被发现得太晚。因此，对高危患者进行筛查，以便他们及时启动服用抗凝血药物进行预防是很重要的。心电图是目前**能检测AF的方法。与AF相关的临床风险因素（如年龄较大、既往中风史、肥胖、高血压、糖尿病和心力衰竭等）被用来确定适合心电图筛查的亚人群。而这些风险因素单独或联合使用...
2021-12-03
随着蛋白检测技术和生物信息学与统计学算法的发展，以疾病研究为主要目的之一的人类蛋白质组计划正快速推进。蛋白质生物标志物在疾病早期诊断和临床治疗等方面有着非常重要的意义，其发现策略和方法的研究已成为一个重要的热点领域。传统大队列样本的蛋白质筛选主要基于质谱进行检测，随着临近延伸分析（Proximity Extension Assay，PEA）检测技术的出现，弥补了质谱在血液样本检测中的缺陷，为...
2021-12-03
近日，上海交通大学瑞金医院呼吸与危重症学科瞿介明教授、瑞金医院上海血研所诸江教授，和时任上海公共卫生临床中心的卢洪洲教授等多个研究团队合作，在国家转化医学中心（上海）陈赛娟院士及印彤研究员团队的支持下，在国内**期刊Cell Research （2021 Impact Factor = 25.617）发表研究论文，首次揭示可区分持续无症状（persistently asymptomatic）...
2021-05-26
近几年，生物质谱技术可谓是日新月异。随之与其搭配的实验技术也层出不穷、五花八门（如图1）；对于初入蛋白质组学的研究学者来说，选择什么技术路线来实现自己的研究目的？如何设计实验方案傻傻搞不清楚，今天我们就来看一下“新晋网红”DIA与“老牌实力派”TMT/iTRAQ、label free各自有何神通之处？图1 | 蛋白质组学技术汇总DIA、TMT/iTRAQ、传统Label free区别Labe...
2020-06-24
Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera36.216Cell . 2020 May 28;S0092-8674(20)30627-9. doi: ...
2020-02-19
随着质谱仪器的不断更新换代，蛋白组学的技术也不断的革新，从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性；从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术，每一次的技...
2019-03-08
磷酸化蛋白组 在酸性条件下，TiO2表面带正电，可与磷酸化肽段产生静电作用而达到富集效果。经TiO2富集后的多肽产物再进行液相色谱质谱（LC-MS）分析，即可获得磷酸化肽段的序列信息和磷酸键的位置信息。 TiO2...
2019-03-08
SILAC标记定量 SILAC技术是由美国Thermo Fisher公司研发的一种多肽体内标记技术。该技术是将重型和轻型13C或15N同位素分别标记在L-赖氨酸和L-精氨酸两种必需氨基酸上。细胞经必需氨基酸培养5-6代后，所有...
2015-07-10
Label Free定量 蛋白质非标记定量技术（Label Free），是直接通过液相色谱质谱（LC-MS）技术结合复杂的数据分析方法对蛋白质酶解肽段进行半定量检测的技术。目前Label Free主要的数据分析方法是利用Max... |
