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m6A甲基化测序

背景简介

  近年来RNA上修饰逐渐成为研究的热点,包括N6甲基腺苷修饰(m6A)、N1甲基腺苷修饰(m1A)、甲基胞嘧啶修饰(m5C)、假尿苷修饰(Ψ)等。作为mRNA中最常见的甲基化修饰,m6A主要富集在mRNA的启动子区、终止密码子区附近。作为一种可逆化修饰,RNA既可以在甲基化转移酶的作用下发生m6A甲基化修饰,又可以在FTO、ALKBH5等酶的作用下发生去甲基化修饰。

       已知mRNA 5’ UTR处的甲基化修饰,作用包括维持mRNA稳定性、mRNA前体剪切、多腺苷酸化、mRNA运输与翻译起始等。而3’ UTR 发生的修饰有助于出核转运、翻译起始,以及与polyA结合蛋白一起维持mRNA的结构稳定。另外RNA甲基化阅读蛋白还能识别miRNA初级体上的m6A修饰,有助于miRNA成熟体的加工。一旦参与m6A修饰的酶出现异常会引起一系列疾病,包括肿瘤、神经性疾病、胚胎发育迟缓等。


技术优势


携手RNA甲基化研究国际知名团队,深度优化实验与分析流程

提炼数十篇**RNA甲基化文章思路,量身定制前沿实验方案

提供多组学整合分析与功能验证一站式服务,大幅缩短实验周期

**的数据挖掘团队+丰富的论文审稿经验,加速科研成果发表



技术路线



分析内容


1、测序序列统计与质控

2、参考基因组比对:参考基因组比对Reads统计,参考基因组比对区域分布,测序数据比对分布

3、全基因组Peak扫描:Peak calling,Peak 注释

4、差异Peak分析:差异Peak信息统计,差异Peak基因GO富集分析,差异Peak基因KEGG富集分析

5、Motif分析


   

样本要求


组织湿重:推荐800mg起,心肝脾>脑肺肾>骨

细胞样本:推荐5x107

总RNA量:total RNA>200ug,mRNA约为10-30ug起

由于物种及样本类型不一,具体送样量请咨询我司技术人员。


近期用户文章   

1.Alarcón C R, Goodarzi H, Lee H, et al. HNRNPA2B1 Is a Mediator of m(6)A-Dependent Nuclear RNA Processing Events.[J]. Cell, 2015, 162(6):1299-1308.

2. Alarcón C R, Lee H, Goodarzi H, et al. N6-methyl-adenosine (m6A) marks primary microRNAs for processing[J]. Nature, 2015, 519(7544):482.