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蛋白质组
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蛋白质组学介绍

蛋白质组(Proteome)是指基因组表达的所有相应蛋白质的集合,即细胞、组织或机体全部蛋白质的存在及其活动方式。蛋白质组学(Proteomics)是指利用高分辨的蛋白质分离技术和高效的蛋白质鉴定技术在蛋白质水平上整体性、动态和定量地研究生命现象及规律的科学,是系统生物学的有机组成部分。

蛋白质组是空间和时间上动态变化着的整体,一个基因组对应多个蛋白质组。相比稳定的基因组,蛋白质组是遗传信息、环境因素、生活习惯等多因素的综合体现。同一细胞/组织,在不同时间/不同环境条件下蛋白谱的表达也存在不同。如上图所示:线粒体呼吸链酶家族的蛋白表达水平不仅在不同成人器官中存在显著差异,同样在心脏中,胎儿与成人蛋白表达量也差异巨大。因此,蛋白质组是最能实时反映细胞/组织功能和疾病发生状态的一类分子,也是疾病发生最相关的分子类型,具有广阔研究前景。

蛋白质组学定性原理

基于LC-MS/MS技术的蛋白质组定量技术一般分为标记法和非标记法两种类型。目前常用的标记法有:iTRAQ(体外)、TMT(体外)、SILAC(体内)三种基于同位素标签进行半定量的方法。以常用的iTRAQ蛋白质组学定量为例(如下图):iTRAQ是由8种(113/114/115/116/117/118/119/121)同位素标签组成,在实验过程中将8例不同样品分别酶解成多肽片段分别标记8种同位素标签将8例标记好的多肽样品混合成1例总样品进入LC-MS/MS分析系统二级MS阶段iTRAQ平衡基团发生中性丢失,在低质量区产生多个报告离子计算各报告离子峰面积,获得同一肽段不同样品间的相对丰度差异比值加权计算肽段丰度获得总蛋白质相对定量值。

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蛋白质组学数据分析平台


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2021-12-03
三阴性乳腺癌(Triple-Negative Breast Cancer, TNBC)指雌激素受体 (Estrogen Receptor, ER)、孕激素受体 (Progesterone Receptor, PR)、人表皮生长因子受体-2 (Human Epidermal Growth Factor Receptor 2, HER-2)表达均为阴性的一类乳腺癌,约占浸润性乳腺癌病例的15-2...
2021-12-03
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2021-12-03
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2021-12-03
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2021-12-03
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2020-02-19
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2019-07-16
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2019-03-08
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2019-03-08
外泌体(Exosome)是活细胞分泌的来源于晚期核内体(也称为多囊泡体 )的直径30-150nm的纳米级脂质包裹体...
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