发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。高通量测序技术突破了传统技术方法的局限，可以直接以标本中所有的遗传物质为研究对象，从而能够快速地鉴定出标本中存在的病毒，形成了一门研究特定环境中病毒群落的新兴学科：病毒宏基因组学（宏病毒组）。

传统意义上有很多用于发现新病毒的方法，如病毒分离、核酸检验、血清学试验等，但它们都有一定的局限性。但利用高通量测序发现新病毒具有信息量大、对标本所含信息无偏倚、操作较简单、检测成本较低等独特优点，使得该技术已成为目前病毒发现中最为重要的技术之一，其在病毒诊断、溯源、预警等方面具有实用意义。

病毒宏基因组测序，又叫宏病毒组测序（Virome），是直接以环境样本中所有病毒的遗传物质为研究对象，记性病毒分析生物学检测的技术，能够快速准确的鉴定出环境中所有病毒的组成，在病毒发现、病毒溯源、微生物预警研究等方面有重要作用。

2018年，全球病毒组计划 (The Global Virome Project) 启动，旨在鉴定出地球上大部分未知病毒。丰富病毒参考数据库如NCBI、JGI，构建新的海洋病毒数据库（GOV）。病毒组序列鉴定分类，对于研究病毒与宿主功能互作意义重大！

直接或间接参与地球生物化学循环；

调控寄主群落结构；

病毒与寄主共进化推动地球生态系统的多样性；

多样本物种分布条形图

相关性heatmap图

多样本RDA/CCA分析

STAMP 分析（样本间）