ATAC-Seq介绍 ATAC-seq ( Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是使用高通量测序对 Tn5 转座酶可接近的核染色质区域进行测序分析的一种研究技术;该技术由美国斯坦福大学的研究人员开发,2013 年首次发表在 Nature Methods(Buenrostro et al., 2013)。通过转座酶对特定时空下开放的核染色质区域进行切割,获得在该时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。 应用领域 1. ATAC-seq 技术可以进行样本之间差异的染色质开放位点的比较,通常并不单独使用。作为检测表观遗传-染色质开放状态现象的方式,与样本基因表达谱紧密相连,从靶标基因的表观状态关联到表达水平,具有强大的数据挖掘作用。 技术优势 时间短:ATAC-seq实验过程短,从实验到分析最快可达2周 实验流程 |