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叶绿体、线粒体基因组测序

产品介绍:

在高等生物细胞内除了细胞核遗传外,细胞质遗传也是重要的研究方向。细胞质中主要的遗传物质的载体是线粒体和叶绿体。利用高通量测序技术动植物线粒体基因组植物叶绿体基因组进行测序组装,突破传统mt/cpDNA分离提纯的实验壁垒,可直接利用组织总DNA获得线粒体/叶绿体基因组,对序列信息进行深入解析,通过比较基因组分析获得物种分类、系统进化、地理谱系遗传等信息

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云生物自主研发的Enrichment富集技术,可降低核DNA污染,将总DNA中靶细胞器基因组比例提升。专业生物信息团队,提供人工基因注释矫正,满足NCBI数据库上传要求,高质量结果交付,助力高水平研究。

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技术流程:

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技术优势:

1. 业内**的mtDNA&cpDNA富集抽提服务:自主研发的细胞器基因组富集提取技术,高效实现高质量细胞器基因组富集。

2. 一对一的生物信息分析,人工基因注释矫正:告别在线注释平台的偏差,满足NCBI数据库上传要求,高质量结果交付,助力高水平研究。

3. 核心技术团队负责人均9年以上从业经验,项目经验丰富,提供可以个性化方案定制。

4. 已完成叶绿体&线粒体基因组项目数百例,96%以上样本实现完成图水平交付。

5. 配套数据库构建服务,提升科研水准,助力高水平研究发表。


取样指南:


分析示例:

叶绿体/线粒体基因组全图

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多数据库功能注释

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基因组多态性分析

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基因组线性结构比较

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IRs边界的收缩与扩张

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比较基因组共线性分析

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泛基因组共有/特有基因统计

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系统进化树

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叶绿体与线粒体片段交流分析

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SSR分类统计

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项目经验(近期部分客户文章):

1. Comparative chloroplast genomics of the genus Taxodium. BMC Genomics(IF=3.501), 2020.

2. Complete Chloroplast Genomes of Three Medicinal Alpinia Species: Genome Organization, Comparative Analyses and Phylogenetic Relationships in Family Zingiberaceae. Plants (IF=2.632) 2020.

3. Mitochondrial variation in small brown planthoppers linked to multiple traits and likely reflecting a complex evolutionary trajectory.Molecular Ecology (IF=5.855) 2019.

4. Candidate Gene Selection for Cytoplasmic Male Sterility in Pepper (Capsicum annuum L.) through Whole Mitochondrial Genome Sequencing. International journal of Molecular Sciences   (IF=3.678), 2019.

5. The Chloroplast Genome of Carya illinoinensis: Genome Structure, Adaptive Evolution, and Phylogenetic Analysis. Forests (IF=2.116), 2020.

6. The complete mitochondrial genome of Calyptogena marissinica (Heterodonta: Veneroida: Vesicomyidae): Insight into the deep-sea adaptive evolution of vesicomyids.PLoS One (IF=2.776) 2019.