DNA甲基化修饰类型
Whole genome bisulfite sequencing, WGBS ——DNA甲基化检测最有力的工具
Improved Reduce Representation Bisulfite Sequencing, 强化RRBS——高性价比DNA甲基化检测方案
项目介绍 简化基因组甲基化测序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS) 是通过限制性酶切的方法 技术优势 从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析, 每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计; 及时高效的沟通;以保障高质量研究成果。 信息分析 基于简化基因组范围的甲基化分析,数据质控,5mC Calling, 5mC在基因组、染色体、功能元件上的分布, 多样本甲基化差异聚类,差异甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析, 结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。 分析内容 Targeted Bisulfite Sequencing, 高通量BSP——目标位点/基因甲基化验证方案
技术优势 高效灵活的目标区域甲基化检测的工具 BSP和高通量测序完美结合,单碱基分辨率 适合几个到几十个位点的大样本验证项目 适合所有动物样本、周期快、检测位点灵活、性价比高 科学方案设计 从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析 每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计 及时高效的沟通;以保障高质量研究成果 样本要求:基因组DNA: >= 1 ug (20个区域/位点);样品浓度>30 ng/ul;无RNA和蛋白污染 建库测序:测序策略:Illumina HiSeq, PE150;测序深度:>100X 信息分析 基于靶向序列的甲基化分析,数据质控,5mC Calling, 5mC在组间样本的可视化,多样本甲基化聚类 与临床样本特征关联分析等 分析内容 项目介绍 N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一,在细菌、藻类及植物基因组中广泛存在,在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DNA片段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、高效地寻找6mA甲基化区域。 技术优势 全基因组范围鉴定6mA甲基化修饰区域 技术方法适合所有物种(一般推荐藻类及植物) 科学方案设计 从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析 每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计 及时高效的沟通;以保障高质量研究成果 样本要求:基因组DNA: >= 5ug;样品浓度>50 ng/ul;无RNA和蛋白污染 建库测序:测序策略:Illumina HiSeq, PE150;测序深度:20-30M Reads 信息分析 基于全基因组范围的6mA分析,数据质控、Peak锋Calling, Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布, 多样本甲基化差异聚类、DMR鉴定及相关基因的功能分析, 结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。 项目介绍 甲基化DNA免疫沉淀测序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq)是通过5mC特异性抗体富集甲基化的DNA片段, 技术优势 全基因组范围鉴定甲基化修饰区域 针对性检测基因组内具有甲基化修饰的区域 与WGBS技术相比,成本更低 科学方案设计 从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析 每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计 及时高效的沟通;以保障高质量研究成果 样本要求:基因组DNA: >= 3ug;样品浓度>50 ng/ul;无RNA和蛋白污染 建库测序:测序策略:Illumina HiSeq, PE150;测序深度:20-30M clean reads 信息分析 基于全基因组范围的甲基化分析,数据质控,Peak锋Calling, Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布, 多样本甲基化差异聚类,差异甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析, 结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。 分析内容 项目介绍 羟甲基化DNA免疫沉淀测序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,hMeDIP-Seq)是通过5hmC特异性抗体富集羟甲基化的DNA片段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、高效地寻找羟甲基化区域。可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。 技术优势 从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析 每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计 及时高效的沟通;以保障高质量研究成果 样本要求:基因组DNA: >= 3 ug;样品浓度>50 ng/ul;无RNA和蛋白污染 建库测序:测序策略:Illumina HiSeq, PE150;测序深度:20-30M reads 信息分析 基于全基因组范围的羟甲基化分析,数据质控,Peak锋Calling, Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布, 多样本羟甲基化差异聚类,差异羟甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析, 结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。 分析内容 DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴,已经越来越受到研究者的关注。近些年来,随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联... DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基... DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基... DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基... DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。近年来,大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传... Agilent 甲基化芯片通过SurePrint芯片合成专利技术,结合优化的探针设计及实验方法,可灵活进行甲基化研... DNA甲基化是在DNA甲基化转移酶(Dnmt)的作用下将甲基选择性地添加到胞嘧啶上形成5-胞嘧啶的过程,刚被发现时... RNA甲基化修饰(2)——如何检测m6A RNA甲基化修饰(1)——m6A概念 手把手教你如何开展m6A实验 RNA甲基化m6A 2019国自然整体情况从生命科学部和医学科学部总体来看:2019年度,生命科学部获自然科学基金委批准资助6478项... 技术简介:甲基化是表观修饰的重要部分,DNA甲基化可以引起DNA构象、稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从... 产品介绍:羟甲基化DNA免疫沉淀测序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitat... 产品介绍:重亚硫酸盐处理结合测序是目前检测甲基化的金标准。在目标区域/位点的甲基化检测和验证环节,我们首次将BSP... 产品介绍简化基因组甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencin... 技术描述 DNA甲基化对于表观遗传学调控机制的时空特异性研究具有重要意义,因而成为表观遗传学的研究热点。而全基因组水平的甲基化测序被认为是DNA甲基化研究的金标准,具有单碱基的分辨率,覆盖范围广等优势而被广泛应用。 B... 将待测DNA经过亚硫酸盐处理,通过PCR扩增过程引入T7启动子序列,经T7 DNA聚合酶的体外转录过程得到各样... 高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melt , HRM)是一种最新的在表观遗传学中检测 CpG 位点的新技术,主要是根据DNA序列的长度、GC含量、碱基互补性差异和特定饱和染料可以插入DNA双链中的特性,应用高... 亚硫酸氢盐处理后测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是检测基因甲基化的经典方法... |