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修饰蛋白质组学 Modified proteomics 翻译后修饰是指由于共价键作用或者某些酶的催化,蛋白质在侧链或者某些位点发生的基团修饰,这些修饰可以发生在mRNA的翻译过程中,而且可以使得蛋白质具备相应的功能。蛋白质翻译后修饰主要包括乙酰化、磷酸化、泛素化等,它们在细胞信号转导等生物过程中起到非常重要的作用。
蛋白质翻译后修饰在生命体中具有十分重要的作用. 它使蛋白质的结构更为复杂, 功能更为完善, 调节更为精细, 作用更为专一。 常见的蛋白质翻译后修饰过程中磷酸化修饰参与生理功能突出,主要涉及细胞信号转导、神经活动、肌肉收缩以及细胞的增殖、发育和分化等生理病理过程。对磷酸化蛋白组研究主要的方法有通过TiO2富集技术以及与iTRAQ技术联合使用。 技术的特点
应用领域 临床疾病标志物的筛选,作用机制研究,
药物作用靶点研究,疾病的分子分型等。 实验流程
分析内容
样本要求
送样要求 收集细胞(尽量避免使用胰酶),整个样本处理收集过程中都需要磷酸酶抑制剂,蛋白样本干冰运输。 仪器设备
Thermo Orbitrap Fusion
Sciex Triple TOF 6600质谱仪 乙酰化修饰 氨基酸的乙酰化修饰是一种可逆的在真核细胞和原核细胞中都能表达的翻译后修饰过程。乙酰化修饰的重要作用,包括DNA-蛋白质相互作用、亚细胞定位、转录活性、蛋白质稳定性等等。 技术的特点 通过质谱技术和富集处理,乙酰化修饰蛋白定性定量,修饰肽段的修饰位点进行大通量的检测。 实验流程
分析内容
样本要求
送样要求 收集细胞(尽量避免使用胰酶),干冰运输;蛋白样本干冰运输 仪器设备
Thermo Orbitrap Fusion
Sciex Triple TOF 6600质谱仪 泛素化修饰 蛋白质泛素化修饰过程在人体免疫系统调节过程中起到了关键性的作用。与磷酸化修饰过程一样,泛素化修饰过程也是一种可逆的共价修饰过程,它能够调节被修饰蛋白的稳定性、功能活性状态以及细胞内定位等情况。参与调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。 技术的特点 通过质谱技术和富集处理,可对泛素化修饰的蛋白进行大通量的检测。 实验流程
分析内容
样本要求
送样要求 收集细胞(尽量避免使用胰酶),干冰运输;蛋白样本干冰运输 仪器设备
Thermo Orbitrap Fusion
Sciex Triple TOF 6600质谱仪 Molecode™ Inflammation Plus,基于自主研发的单分子邻近编码技术smPBA(single molecule Proximity Barcoding Assay, smPBA),本产品通过特异性抗体捕获目标蛋白,同时利用修饰探针和识别探针在蛋白分子上邻近识别并获得相同的独特编码,实现蛋白及其翻译后修饰的共检测。
图1|smPBA工作原理图 Molecode™ Inflammation Plus可在微量血浆(< 5 μL )或多种体液样本中同时定量检测200种炎症相关蛋白及10种翻译后修饰(PTMs),覆盖细胞因子、趋化因子、免疫受体、补体组分及信号转导分子等关键炎症通路,为炎症机制研究、免疫通路解析与疾病标志物发现提供新的研究工具。
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