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动植物基因组 de novo测序

产品介绍:

基因组de novo测序,又名从头测序,指不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用生物信息学分析方法进行基因组的拼接、组装,获得该物种的基因组序列图谱,从而推进该物种的后续研究。

云生物整合多种优势技术及信息分析平台,涵盖illumina,Pacbio, Nanopore等多种测序平台,10x Genomics 长片段读取技术, Bionano单分子光学图谱技术,Dovetail TM Hi-C及Dovetail TM Chicago三维基因组技术,NRGene基因组组装算法等,为广大科研工作者提供国际领先的动植物基因组de novo测序方案

技术流程:

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技术特色:

高难度基因组解决方案:技术平台联手以色列NRGene,实力挑战超大、超复杂、高重复、多倍体及高杂合基因组

多种技术组合方案:满足您不同层次分析要求。可实现最为完整的基因组组黄,为遗传学发现、性状发现、关联研究、基因组选择与基因编辑等提供坚实的基础框架。

实力雄厚,经验丰富。技术团队负责人均9年以上大型动植物基因组研究领域工作经验,完成复杂高难度基因组项目数十项,具有丰富的基因组组装及深度挖掘项目经验。


分析示例:

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基因组总览

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基因组共线性分析

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基因家族扩增与收缩

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PSG全基因组分布


项目经验(部分客户文章)

1. Gossypium barbadense and Gossypium hirsutum genomes provide insights into the origin and evolution of allotetraploid cotton. Nature genetics, 2019.(陆地棉和海岛棉,IF=25.455

2. Chromosome-level assembly of the water buffalo genome surpasses human and goat genomes in sequence contiguity.Nature Communications, 2019.(水牛,IF=11.878

3. Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice. Nature, 2019.(水稻,IF=41.577

4. The Medicinal Herb Panax notoginseng Genome Provides Insights into Ginsenoside Biosynthesis and Genome Evolution.Molecular Plant, 2017.(三七,IF=9.326