测试调用测试设计Survival生存曲线绘制软件环境微生物多样性软件转录组分析软件转录组软件购买重测序软件环境微生物多样性软件(1)桌面软件中药空间代谢组学检测中药非靶代谢组检测中药活性成分鉴定中药入血/入靶成分分析中药组学ATAC-seqCHIP-seqHi-C测序基因调控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因组鉴定分析工具)网页分析系统WEB分析系统澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude® 样品管标记系统Hi-C建库试剂盒及基因组组装软件无血清细胞冻存液Cell Freezing Medium纳米流式检测仪lexogen支原体检测试剂盒仪器试剂耗材数据库开发数据中心TCGA生存数据包功能医学报告系统开发PlantArray植物生理组平台特色服务单细胞测序空间转录组测序空间代谢组DSP空间蛋白质组FFPE石蜡包埋组织单细胞转录组解决方案:10×Flex空间多组学类器官叶绿体、线粒体基因组测序染色体级别基因组组装Hi-C建库基因芯片一代测序动植物基因组de novo测序细菌基因组测序真菌基因组测序病毒基因组测序简化基因组遗传图谱测序简化基因组GWAS测序基因组重测序表观组基因分型外显子捕获目标区域捕获简化基因组遗传图谱性状定位扫描图DNA中5-hmC图谱测定全基因组甲基化测序真菌基因组扫描图测序epiGBS-简化甲基化BSA混池测序基因组SSR开发基因组(DNA)UMI-RNAseq转录组测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全转录组测序circRNA测序Lnc RNA测序Small RNA测序circRNA芯片表达谱芯片m6A甲基化测序互作转录组测序降解组测序UMI-RNAseqSLAM-seq测序(RNA代谢测序)转录组(RNA)三代全长扩增子Meta-Barcoding(eDNA)技术研究微生物多样性二代测序宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序HiC-Meta宏基因组宏转录组差异表达测序宏病毒组测序环境DNAHiFi-Meta宏基因组肠道菌群临床检测基于肠道菌群检测和移植的肠道微生态学科建设宏基因组元素循环测序三代宏基因组宏基因组免疫球蛋白测序(Mig-seq)肠道宏基因组绝对定量医学宏病毒组测序微生物组蛋白组代谢组抗体芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中药代谢组ENGINE-生物标志物检测服务ENGINE-抗体特异性服务4D蛋白质组Raybiotech芯片OLINK精准蛋白质组学解决方案常规定量蛋白质组蛋白质组定性分析靶向蛋白质组学修饰蛋白质组学非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学新一代代谢组学 NGM ProLenioBio无细胞蛋白表达系统ALAMAR超灵敏蛋白组学及蛋白标志物转化平台超高深度血液蛋白质组蛋白和代谢组GC-MS全代谢组LC-MS全代谢组靶向代谢组脂质组学代谢组学反向色谱柱原理的DNA/RNA提取技术分子生物学CRISPR基因编辑细胞定制细胞株构建iPS构建CRISPR/Cas9DNA甲基化修饰细胞FAQ基因编辑切片图像扫描组织芯片免疫组化微量基因组建库专家病理切片数字存档多色免疫荧光组织透明化技术服务病理形态学数据陪护扩增子时序分析基因突变体克隆动物中心小动物疾病模型构建和检测服务基因编辑小鼠动物实验支原体污染检测服务细胞系遗传背景鉴定细胞系鉴定外泌体全转录组测序外泌体分离与鉴定PBA单外泌体邻近编码技术PBA单外泌体蛋白质组学分析服务PBA单外泌体蛋白组样本指南PBA外泌体免疫相关文献外泌体专题甲基化APOBEC偶联甲基化测序ACE-seq焦磷酸测序cfDNA甲基化测序DNA甲基化测序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因组甲基化测序(WGBS)简化基因组甲基化测序 (RRBS)目标区域甲基化测序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀测序 (MeDIP-seq)氧化-重亚硫酸盐测序 (oxBS-seq)TET-重亚硫酸盐测序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高灵敏度的羟甲基化检测羟甲基化免疫共沉淀测序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)甲基化专题RNA修饰研究专题免疫印迹(Western-blot)技术服务定量Western检测Simoa单分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM测序PCR array数字PCR精准检测ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因调控Ribo-seq核糖体印迹测序技术Active Ribo-seq活跃翻译组测序技术翻译组数据分析数据库构建数据价值提升10x官方发布样本准备样本要求样本取材以及样本编号技巧精简版细胞库组织库动物模型转录组样本准备蛋白组样本准备代谢组样本准备Hi-C单细胞与空间转录组单细胞悬液外泌体Raybiotech蛋白芯片Simoa样本准备PBA单外泌体样本准备ASA基因分型芯片样本准备NULISA超灵敏蛋白组样本准备Olink 精准蛋白组样品准备CyTOF质谱流式样本准备样本准备要求表单留言板SaaS 帮助搜索Mac谷歌浏览器2019国自然基金查询生信相关工具集合数据分析项目信息单提交资料分享核酸抽提产品资料转录组软件教学视频微生物多样性软件教学视频Lexogen产品培训视频Olink精准蛋白组学专题在线学习空间转录组文献PBA单外泌体蛋白组文献NULISA微量蛋白检测文献OLINK精准蛋白组文献项目进度个人中心会员登录会员注册购物车联系我们公众号手机商城公司愿景知识分享文献展示
当前位置
宏基因组测序

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产品介绍

宏基因组(metagenome是指特定环境中全部生物(微生物)遗传物质的总和。宏基因组测序以特定环境中的整个微生物群落作为研究的对象,不需对微生物进行分离培养,而是提取环境微生物总DNA进行研究。其摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,在基因组水平解读微生物群体的多样性和丰度,探索微生物与环境及宿主之间的关系。目前,第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被广泛应用。第二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点,加快了宏基因组测序在鉴定低丰度的微生物群落,挖掘更多基因资源方面的应用。



02

分析流程



03

技术参数


实验策略

测序量

项目周期

400bp左右小片段文库

常规 10G-20G raw data

50个工作日




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技术特色

  • 无需分离培养微生物,突破传统纯培养技术限制,为研究和开发超 99% 的未可培养微生物提供了新途径与有效策略;

  • 基于三十余种数据库进行功能注释,解析微生物基因资源,为多领域挖掘生物分子机制提供助力;

  • 可以得到环境中丰度较低的微生物,为研究低丰度微生物提供了途径;

  • 分析内容涵盖六大分析模块,80+分析内容,结果图可直接用于文章发表;

  • 多组学关联分析,可关联代谢组等研究结果,全方面深化研究。



05

送样要求

样品类型

送样要求

保存及运输

常规土壤

采样时应去除地表杂质,根据需要挖取相应深度(如 5~20 cm)的土壤,置于冰上运至实验室。去除可见杂质,建议过2 mm 无菌筛网。同一样方多点样本等量混合均匀后取 5~10 g,保存无菌 EP 管中。

样本-80℃或液氮中长期保存,干冰运输
根际土壤

矮小植物:收集植物植株,去除根部大块土壤;摇动植株去除松散土壤,使用无菌刷子收集根部附着紧密的土壤;同一样方多点样本等量混合均匀,过2mm筛后,分装至2mL或更大体积的EP管或冻存管中;每管土壤含量大概0.25~0.5g,需保证送样量在1~2g

高大林木:采集地面下10-20cm根际土壤,置于冰上运至实验室。去除可见杂质,建议过2-5 mm 无菌筛网。同一样方多点样本等量混合均匀后取 5~10 g,保存无菌 EP 管中。

水体

采样后进行滤膜过滤,选择合适孔径的滤膜,对于澄清水体或者略浑浊水体,选用0.22μm 或者 0.45μm 的滤膜,取样体积大于 5L;对于浑浊水体,建议先用3-4cm 滤膜过滤一遍,再用小孔径的滤膜过滤;送样量:滤膜 1-2 张;水体泥样的采集提供大于 5g 样本。

活性污泥
地表沉积物

活性污泥:从活性污泥装置中取大于 10 ml 的悬浮污泥样本(约 5-10 g 沉降物),保存无菌 EP 管中,放入液氮或置于冰上,立即运至实验室。若液态污泥样本沉降物较少,可适当增加取样量。

水体/地表沉积物:取距离水底/地表 0-10 cm(具体按实验需要而定)的沉积物 5~10 g,保存无菌取样袋或EP 管中,置于冰上运送至实验室。

空气

使用空气抽滤机,使空气通过 0.22 μm 滤膜,滤膜上有可见覆盖物(过滤时间越长,收集的空气中的灰尘越多,菌数量越多),收集完成后取下滤膜。滤膜置于冻存管中,液氮速冻,干冰寄送到实验室。

粪便

无菌牙签或用无菌勺挖取粪便中段没有接触空气和地面的部分,挖取一满勺(3-5 g)。小鼠至少 3-5 粒粪便。将已取的粪便样品分装至2mL EP管(无菌)或冻存管(无菌)中,每管粪便量为0.5~2g,每个样品分装2~3管备份。

肠道内容物

在实验对象死亡后,无菌条件下,取出整个肠道,用无菌解剖刀切取所需肠段的,用无菌手术刀挖取内容物 ,立即放在冰上进行分装并标记,分装至2mL EP管(无菌)或冻存管(无菌)中,每管组织量为0.5~2g,每个样品分装2~3管备份





06

分析示例


宏2.png

多样本物种分布条形图




宏3.png

相关性heatmap


宏4.png

多样本RDA/CCA分析



宏5.png

STAMP 分析(样本间)