互作转录组测序

产品介绍

物种间存在广泛的相互作用，包括寄生、共生、竞争等，而普通的转录组只能研究单一物种的信息，不仅浪费-部分数据，而且在分离中也会对样本本身造成一定的影响。

互作转录组（Dual RNA-seq），无需分离两物种，避免分离造成的干扰，只构建一个转录组文库，便能同时对2个（或多个）物种进行测序和分析，从而揭示互作物种间基因表达的动态变化。同时，还可以通过互作模型图获得物种间基因的调控关系，得到两物种间的相互作用机制。研究互作过程中的调控网络、病原菌感染宿主致病机理和宿主抗病的机制；研究致病性菌在不同物种之间的进化关系、基于同源基因进一步发掘正选择相关基因等。互作转录组主要是针对解决病原体和宿主之间互作的问题。主要特征在于同时对宿主和病原体进行测序和分析，主要区分与之前的单独对宿主测序和分析，和单独对病原体测序和分析。当然两者同时测序和分析，主要是依赖于建库和测序技术的提升。

技术流程

技术优势

RNA总量：RNA总量≥2ug；

RNA纯度：OD260/280在1.8-2.0之间，核酸完整无降解。

送样要求

RNA总量：RNA总量≥2ug；

RNA纯度：OD260/280在1.8-2.0之间，核酸完整无降解。

分析示例

各样品reads 在unigene上覆盖情况的IGV 展示截图

表达量( FPKM scores )分布图

样品间聚类结果

差异基因可视化散点图及火山图

上下调差异基因GO注释柱形图

KEGG富集图

表达差异基因聚类图

WGCNA共表达网络分析

蛋白网络构建及分析(PPI)

宿主-病原菌互作模型（使用 FCM 方法对差异基因聚类图）

宿主病原体互作网络图