10x Flex技术采用4%多聚甲醛（PFA）对细胞进行固定，一步锁定RNA表达状态，有效解决了样本储存和多样本批次处理的问题，并成功解锁了FFPE样本在单细胞转录组测序中的应用潜力。PFA固定细胞，便于在一定时间内储存和运输，不必再争分夺秒，担心细胞活性。

10x FLEX单细胞转录组测序技术，有别于新鲜解离单细胞转录组测序基于poly(A)捕获的方法，FFPE样本采用的是利用探针杂交捕获基因的方法，探针组作用包括检测基因表达与提供分组信息。每个样本与不同的探针进行杂交，数据分析时可通过识别不同的Barcode将不同样本来源的Reads区分开。目前FLEX方案仅可应用于人和小鼠样本。