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MethylationEPIC BEadChip(850k)甲基化芯片
技术简介
样本要求
报告模板
技术支持

DNA甲基化对基因表达调控起着动态的重要作用。 借助MethylationEPIC BeadChip,研究人员可以基于单核苷酸分辨率定量检测基因组中的850,000多个甲基化位点。包括FFPE在内的多重样本可以并行分析,以便在每样本最低成本的情况下实现高通量功能。依托业界领先的Infinium实验分析方法,MethylationEPIC BeadChip是全表观基因组关联研究(EWAS)的理想之选。它提供了由专家精选的全面的覆盖范围,囊括99%的RefSeq基因,95%的CpG岛,高覆盖度的增强子区域和其他内容类别。由于超过90%的Infinium HumanMethylation450K位点内容都涵盖在内,因此新一代MethylationEPIC试剂盒对这些位点也完全支持。

技术优势

       MethylationEPIC BEadChip兼具全面的覆盖范围和高通量功能,因此是EWAS的理想之选。其他优势包括:


  • 全面的全基因组覆盖范围(> 850,000个甲基化位点)

    • CpG岛

    • 非CpG和差异甲基化位点

    • FANTOM5增强子

    • ENCODE染色质

    • ENCODE转录因子结合位点

    • miRNA启动子区域


  • 实验分析方法重现性

    • 98%(针对技术性重复)

    • 98%(针对传统HumanMethylation450K芯片对照,MethylationEPIC芯片采用的相同样本)

    • >90%(针对HumanMethylation450K位点内容)


  • 用户友好的简化工作流程


  • 与FFPE样本兼容

         MethylationEPIC BeadChip遵循用户友好的简化的工作流程,可以从低样本起始量(低至250 ng)同时处理多达96个样本

  该甲基化芯片针对常规样本和FFPE样本提供单CpG位点级别的定量测量,因此能实现超级精细的解析度,方便用户了解表观遗传的变化。

试剂盒运用一代和二代Infinium实验分析方法化学技术,支持无PCR和低样本输入量(低至250 ng)(在实验前,要对DNA进行质检,另外考虑到实验室间浓度定量的差异,在客户送样时,要求总量大于1ug),浓度大于50ng/ul,260/280>1.6,260/230>1.6。


850K芯片与WGBS参数对比


技术参数850K芯片WGBS
检测物种不受限
检测原理重亚硫酸盐转化重亚硫酸盐转化
起始量250ng2ug
分辨率单碱基单碱基
检测CpG位点>85,000>3,800,000
是否适用于FFPE适用不适用
技术重复R2>0.98
实验周期20个工作日30个工作日
实验费用
10k
检测范围已知位点不受限
数据分析简单困难

















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