测试调用测试设计Survival生存曲线绘制软件环境微生物多样性软件转录组分析软件转录组软件购买重测序软件环境微生物多样性软件(1)桌面软件中药空间代谢组学检测中药非靶代谢组检测中药活性成分鉴定中药入血/入靶成分分析中药组学ATAC-seqCHIP-seqHi-C测序基因调控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因组鉴定分析工具)网页分析系统WEB分析系统澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude® 样品管标记系统Hi-C建库试剂盒及基因组组装软件无血清细胞冻存液Cell Freezing Medium纳米流式检测仪lexogen支原体检测试剂盒仪器试剂耗材数据库开发数据中心TCGA生存数据包功能医学报告系统开发PlantArray植物生理组平台特色服务单细胞测序空间转录组测序空间代谢组DSP空间蛋白质组FFPE石蜡包埋组织单细胞转录组解决方案:10×Flex空间多组学类器官叶绿体、线粒体基因组测序染色体级别基因组组装Hi-C建库基因芯片一代测序动植物基因组de novo测序细菌基因组测序真菌基因组测序病毒基因组测序简化基因组遗传图谱测序简化基因组GWAS测序基因组重测序表观组基因分型外显子捕获目标区域捕获简化基因组遗传图谱性状定位扫描图DNA中5-hmC图谱测定全基因组甲基化测序真菌基因组扫描图测序epiGBS-简化甲基化BSA混池测序基因组SSR开发基因组(DNA)UMI-RNAseq转录组测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全转录组测序circRNA测序Lnc RNA测序Small RNA测序circRNA芯片表达谱芯片m6A甲基化测序互作转录组测序降解组测序UMI-RNAseqSLAM-seq测序(RNA代谢测序)转录组(RNA)三代全长扩增子Meta-Barcoding(eDNA)技术研究微生物多样性二代测序宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序HiC-Meta宏基因组宏转录组差异表达测序宏病毒组测序环境DNAHiFi-Meta宏基因组肠道菌群临床检测基于肠道菌群检测和移植的肠道微生态学科建设宏基因组元素循环测序三代宏基因组宏基因组免疫球蛋白测序(Mig-seq)肠道宏基因组绝对定量医学宏病毒组测序微生物组蛋白组代谢组抗体芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中药代谢组ENGINE-生物标志物检测服务ENGINE-抗体特异性服务4D蛋白质组Raybiotech芯片OLINK精准蛋白质组学解决方案常规定量蛋白质组蛋白质组定性分析靶向蛋白质组学修饰蛋白质组学非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学新一代代谢组学 NGM ProLenioBio无细胞蛋白表达系统ALAMAR超灵敏蛋白组学及蛋白标志物转化平台超高深度血液蛋白质组蛋白和代谢组GC-MS全代谢组LC-MS全代谢组靶向代谢组脂质组学代谢组学反向色谱柱原理的DNA/RNA提取技术分子生物学CRISPR基因编辑细胞定制细胞株构建iPS构建CRISPR/Cas9DNA甲基化修饰细胞FAQ基因编辑切片图像扫描组织芯片免疫组化微量基因组建库专家病理切片数字存档多色免疫荧光组织透明化技术服务病理形态学数据陪护扩增子时序分析基因突变体克隆动物中心小动物疾病模型构建和检测服务基因编辑小鼠动物实验支原体污染检测服务细胞系遗传背景鉴定细胞系鉴定外泌体全转录组测序外泌体分离与鉴定PBA单外泌体邻近编码技术PBA单外泌体蛋白质组学分析服务PBA单外泌体蛋白组样本指南PBA外泌体免疫相关文献外泌体专题甲基化APOBEC偶联甲基化测序ACE-seq焦磷酸测序cfDNA甲基化测序DNA甲基化测序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因组甲基化测序(WGBS)简化基因组甲基化测序 (RRBS)目标区域甲基化测序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀测序 (MeDIP-seq)氧化-重亚硫酸盐测序 (oxBS-seq)TET-重亚硫酸盐测序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高灵敏度的羟甲基化检测羟甲基化免疫共沉淀测序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)甲基化专题RNA修饰研究专题免疫印迹(Western-blot)技术服务定量Western检测Simoa单分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM测序PCR array数字PCR精准检测ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因调控Ribo-seq核糖体印迹测序技术Active Ribo-seq活跃翻译组测序技术翻译组数据分析数据库构建数据价值提升10x官方发布样本准备样本要求样本取材以及样本编号技巧精简版细胞库组织库动物模型转录组样本准备蛋白组样本准备代谢组样本准备Hi-C单细胞与空间转录组单细胞悬液外泌体Raybiotech蛋白芯片Simoa样本准备PBA单外泌体样本准备ASA基因分型芯片样本准备NULISA超灵敏蛋白组样本准备Olink 精准蛋白组样品准备CyTOF质谱流式样本准备样本准备要求表单留言板SaaS 帮助搜索Mac谷歌浏览器2019国自然基金查询生信相关工具集合数据分析项目信息单提交资料分享核酸抽提产品资料转录组软件教学视频微生物多样性软件教学视频Lexogen产品培训视频Olink精准蛋白组学专题在线学习空间转录组文献PBA单外泌体蛋白组文献NULISA微量蛋白检测文献OLINK精准蛋白组文献项目进度个人中心会员登录会员注册购物车联系我们公众号手机商城公司愿景知识分享文献展示
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Copy File to project

分析模块复制输入文件到项目工作目录中,模块输出即为复制的拷贝,复制到项目中的文件内容与原文件一致。在项目中,常用于中转多个模块的输入。

输入:

源文件。

输出:

拷贝文件。

应用场景示例:

Link File to project

分析模块在项目工作目录中创建输入文件链接,类似于快捷方式,模块输出即为创建的链接文件。链接文件指向源文件,相比于文件复制,节省了硬盘空间。在项目中,常用于中转多个模块的输入。

输入:

源文件。

输出:

链接文件。

应用场景示例:

分析模块输入xls格式的Excel表格文件,将其中的表格内容转化为制表符分隔的文本文件。

输入:

xls格式的Excel表格文件。

输出:

制表符分隔的文本文件。

说明:

分析模块进行数据转换的效率低,速度慢,运行时间长!建议通过Excel软件直接进行格式转换,从而得到制表符分隔的文本文件。

步骤如下(Excel 2007版本):

1Excel软件打开xls文件,选择 "另存为" �C> "其他格式"

2、保存类型选择:文本文件(制表符分隔)(*.txt)

3、接着点击 "确定" ""

4、关闭Excel软件。

分析模块,输入Windows/Dos文本文件,输出Unix文本文件。例如换行符,Unix "\n" 表示,Windows "\r\n" 表示。

输入:

Windows/Dos文本文件。

输出:

Unix文本文件。

说明:

Unix文本文件和Windows/Dos文本文件的格式区别参考维基百科:(https://en.wikipedia.org/wiki/Newline)。

分析模块,输入Unix文本文件,输出Windows/Dos文本文件。例如换行符,Unix "\n" 表示,Windows "\r\n" 表示。

输入:

Unix文本文件。

输出:

Windows/Dos文本文件。

说明:

Unix文本文件和Windows/Dos文本文件的格式区别参考维基百科:(https://en.wikipedia.org/wiki/Newline)。

分析模块,输入两个制表符分隔的表格文本文件,根据两个文件中分别指定的列作为关键字进行数据的整合,合并输出具有相同关键字的行。

输入:

1、数据文件一:

chr1

10

20

geneA

chr1

50

80

geneB

chr5

10

40

geneL

2、数据文件二:

geneA

tumor-supressor

geneB

Foxp2

geneC

Gnas1

geneE

INK4a

参数设置为以**个文件的第4列,第二个文件的第1列作为关键字进行合并。

输出:

结果文件:

chr1

10

20

geneA

geneA

tumor-suppressor

chr1

50

80

geneB

geneB

Foxp2

分析模块,将输入的多个文件从头到尾进行连接。比如,连接合并多个fastq原始数据文件成一个文件。

不同类型的文件需要小心进行连接合并,分析模块并不会进行文件格式的确认。

输入:

1、数据文件一:

chrX

151087187

151087355

A

0

-

chrX

151572400

151572481

B

0

+

2、数据文件二:

chr1

151242630

151242955

X

0

+

chr1

151271715

151271999

Y

0

+

chr1

151278832

151279227

Z

0

-

3、数据文件三:

chr2

100000030

200000955

P

0

+

chr2

100000015

200000999

Q

0

+

输出:

连接合并后的结果文件:

chrX

151087187

151087355

A

0

-

chrX

151572400

151572481

B

0

+

chr1

151242630

151242955

X

0

+

chr1

151271715

151271999

Y

0

+

chr1

151278832

151279227

Z

0

-

chr2

100000030

200000955

P

0

+

chr2

100000015

200000999

Q

0

+


分析模块,输入制表符分隔的表格文本文件,根据指定列,进行切列操作,从而得到提取出相应列的表格数据文件。

l   列号用c1,c2指定,逗号分隔,以此类推。列号从1开始计数。

l   列号可以任意顺序进行指定,比如c2,c1,c6

l   如果指定的列在输入数据中不存在,则用符号 "-" 进行填充。

l   c1-c5表示从第1列到第5列数据。

输入:

数据文件(6列:c1, c2, c3, c4, c5, c6):

chr1

10

1000

gene1

0

+

chr2

100

1500

gene2

0

+

输出:

指定 "c1,c4,c6" 将输出:

chr1

gene1

+

chr2

gene2

+

指定 "c6,c5,c4,c1" 将输出:

+

0

gene1

chr1

+

0

gene2

chr2

指定 "c1-c3" 将输出:

chr1

10

1000

chr2

100

1500

指定 "c8,c7,c4" 将输出:

-

-

gene1

-

-

gene2


分析模块,输入两个制表符分隔的表格文本文件,进行列合并操作。

输入:

1、数据文件一:

chr1

10

chr2

100

2、数据文件二:

1000

gene1

1500

gene2

输出:

列合并后的文件:

chr1

10

1000

gene1

chr2

100

1500

gene2


分析模块,提取输入文件头部前n行作为输出。

输入:

取前2行,从数据文件:

chr7

56632

56652

D17003_CTCF_R6

310

+

chr7

56736

56756

D17003_CTCF_R7

354

+

chr7

56761

56781

D17003_CTCF_R4

220

+

chr7

56772

56792

D17003_CTCF_R7

372

+

chr7

56775

56795

D17003_CTCF_R4

207

+

chr7

56632

56652

D17003_CTCF_R6

310

+

chr7

56736

56756

D17003_CTCF_R7

354

+

输出:

结果文件:

chr7

56632

56652

D17003_CTCF_R6

310

+

chr7

56736

56756

D17003_CTCF_R7

354

+

分析模块,输入两个制表符分隔的表格文本文件,根据两个文件中分别指定的列作为关键字进行数据的整合,合并输出具有相同关键字的行。

输入:

1、数据文件一:

chr1

10

20

geneA

chr1

50

80

geneB

chr5

10

40

geneL

2、数据文件二:

geneA

tumor-supressor

geneB

Foxp2

geneC

Gnas1

geneE

INK4a

参数设置为以**个文件的第4列,第二个文件的第1列作为关键字进行合并。

输出:

结果文件:

chr1

10

20

geneA

geneA

tumor-suppressor

chr1

50

80

geneB

geneB

Foxp2

分析模块,在一个数据集指定列中查找与另一个数据集指定列匹配或不匹配的行。

输入:

1、数据文件一:

chr1

10

20

geneA

chr1

50

80

geneB

chr5

10

40

geneL

2、数据文件二:

geneA

tumor-supressor

geneB

Foxp2

geneC

Gnas1

geneE

INK4a

输出:

在数据文件一第4列中查找,与数据文件二第1列匹配的行,将输出:

chr1

10

20

geneA

chr1

50

80

geneB

在数据文件一第4列中查找,与数据文件二第1列不匹配的行,将输出:

chr5

10

40

geneL