快递查询
测试调用测试设计Survival生存曲线绘制软件环境微生物多样性软件转录组分析软件转录组软件购买重测序软件环境微生物多样性软件(1)桌面软件中药空间代谢组学检测中药非靶代谢组检测中药入血/入靶成分分析中药成分鉴定检测中药组学ATAC-seqCHIP-seqHi-C测序基因调控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因组鉴定分析工具)网页分析系统WEB分析系统澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude® 样品管标记系统Hi-C建库试剂盒及基因组组装软件无血清细胞冻存液Cell Freezing Medium纳米流式检测仪lexogen支原体检测试剂盒仪器试剂耗材数据库开发数据中心TCGA生存数据包功能医学报告系统开发PlantArray植物生理组平台特色服务单细胞测序空间代谢组DSP空间蛋白质组Visium空间转录组测序空间多组学类器官基因芯片染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序一代测序动植物基因组de novo测序细菌基因组测序真菌基因组测序病毒基因组测序简化基因组遗传图谱测序简化基因组GWAS测序基因组重测序表观组基因分型外显子捕获目标区域捕获简化基因组遗传图谱性状定位扫描图DNA中5-hmC图谱测定全基因组甲基化测序真菌基因组扫描图测序epiGBS-简化甲基化BSA混池测序基因组SSR开发基因组(DNA)UMI-RNAseq转录组测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全转录组测序 降解组表达谱芯片circRNA芯片circRNA测序Small RNA测序Lnc RNA测序m6A甲基化测序互作转录组测序UMI-RNAseq转录组(RNA)16S扩增子全长测序Meta-Barcoding(eDNA)技术研究微生物多样性测序宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序HiC-Meta宏基因组宏转录组差异表达测序宏病毒组测序环境DNAHiFi-Meta宏基因组肠道菌群临床检测基于肠道菌群检测和移植的肠道微生态学科建设宏基因组元素循环测序微生物组蛋白组代谢组抗体芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片4D蛋白质组Raybiotech芯片OLINK精准蛋白质组学解决方案常规定量蛋白质组蛋白质组定性分析靶向蛋白质组学修饰蛋白质组学非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学蛋白和代谢组GC-MS全代谢组LC-MS全代谢组靶向代谢组脂质组学代谢组学分子生物学CRISPR基因编辑细胞定制细胞株构建iPS构建CRISPR/Cas9DNA甲基化修饰细胞FAQ基因编辑切片图像扫描组织芯片免疫组化微量基因组建库专家病理切片数字存档多色免疫荧光病理形态学数据陪护扩增子时序分析基因突变体克隆动物中心小动物疾病模型构建和检测服务基因编辑小鼠动物实验支原体污染检测服务细胞系遗传背景鉴定细胞系鉴定外泌体全转录组测序外泌体分离与鉴定单外泌体蛋白质组学分析服务外泌体专题甲基化焦磷酸测序cfDNA甲基化测序DNA甲基化测序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因组甲基化测序(WGBS)简化基因组甲基化测序 (RRBS)目标区域甲基化测序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀测序 (MeDIP-seq)氧化-重亚硫酸盐测序 (oxBS-seq)TET-重亚硫酸盐测序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高灵敏度的羟甲基化检测羟甲基化免疫共沉淀测序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)甲基化专题RNA修饰研究专题免疫印迹(Western-blot)技术服务定量Western检测Simoa单分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM测序PCR array数字PCR精准检测ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因调控Ribo-seq核糖体印迹测序技术Active Ribo-seq活跃翻译组测序技术翻译组10x官方发布样本准备样本要求样本取材以及样本编号技巧精简版细胞库组织库动物模型蛋白组代谢组Hi-C单细胞与空间转录组单细胞悬液外泌体Raybiotech蛋白芯片Simoa样本准备样本准备要求表单留言板SaaS 帮助搜索Mac谷歌浏览器2019国自然基金查询生信相关工具集合数据分析项目信息单提交资料分享核酸抽提产品资料转录组软件教学视频微生物多样性软件教学视频Lexogen产品培训视频Olink精准蛋白组学专题项目进度个人中心会员登录会员注册购物车联系我们公众号手机商城公司愿景知识分享
商城导航
  • 仪器
    细胞计数仪细胞复苏仪
    细胞计数仪
    细胞复苏仪
  • 蛋白芯片
    高通量系列芯片抗体芯片通路芯片糖芯片蛋白芯片流式多因子试剂盒
    高通量系列芯片
    抗体芯片
    通路芯片
    糖芯片
    蛋白芯片
    流式多因子试剂盒
  • 试剂
    逆转录酶qPCR Mix启衡星类器官培养流式多因子ELISA试剂盒BDKAPALexogen
    逆转录酶
    qPCR Mix
    启衡星
    类器官培养
    流式多因子
    诊断试剂产品
    Human
    Human PD Panels
    Mouse
    Mouse PD Panels
    ELISA试剂盒
    人ELISA试剂盒
    大鼠ELISA试剂盒
    小鼠ELISA试剂盒
    辅助试剂
    BD
    BD Vacutainer® CPT™
    PAXgene 全血RNA 管
    BDTM P800
    BD™ P100
    KAPA
    Lexogen
    血清
    磐超P&C
    外泌体CD63 & TSG101 蛋白检测试剂盒
    BioEcho
    免疫荧光试剂盒
  • 细胞
    CRISPR定制杂交瘤细胞肝癌系(株)肺癌系(株)乳腺癌系(株)胃癌系(株)结肠癌系(株)食管癌系(株)口腔鼻咽癌系(株)
    CRISPR定制
    杂交瘤细胞
    肝癌系(株)
    肺癌系(株)
    乳腺癌系(株)
    胃癌系(株)
    结肠癌系(株)
    食管癌系(株)
    口腔鼻咽癌系(株)
    卵巢癌系(株)
    绒毛癌系(株)
    膀胱癌系(株)
    宫颈癌系(株)
    前列腺癌系(株)
    畸胎瘤系(株)
    皮肤癌系(株)
    肾癌系(株)
    淋巴骨髓瘤系(株)
    胶质瘤系(株)
    黑色素瘤系(株)
    白血病系(株)
    肉瘤系(株)
    神经母细胞瘤系(株)
    涎腺腺样囊性癌系(株)
    甲状腺癌系(株)
    胰腺癌系(株)
    胆囊癌系(株)
    小肠癌系(株)
    间皮瘤系(株)
    垂体瘤细胞
    肥大细胞瘤细胞
    腹水瘤细胞
    脑瘤细胞
    肿瘤细胞
    正常细胞系(株)
  • 耗材
    样本保存液(游离DNA保存管)口腔拭子采集套装一次性使用采集拭子病毒采样套装唾液样本采集套装尿液采集器粪便采集器HPV自采样宫颈刷
    样本保存液(游离DNA保存管)
    口腔拭子采集套装
    一次性使用采集拭子
    病毒采样套装
    唾液样本采集套装
    尿液采集器
    粪便采集器
    HPV自采样宫颈刷
  • 科研课题设计
  • 数据分析
    分析模块软件系统
    分析模块
    模块套装
    单模块
    分析代码
    软件
    系统
    数据库
    数据分析系统
当前位置
Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒
收藏
|
Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒
价格:
33068.00
货号:
购买数量:
产品详情
产品评论(0)


货号产品规格
139.96QuantSeq-Pool Sample-Barcoded 3' mRNA-Seq Library Prep Kit for   Illumina, 96 preps96

Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒

产品优势:

  • 对于筛查项目是高性价比的基因表达分析方法

  • 批量处理,省时、省力、省成本

  • 可从几个样本到36,864个样本的批量处理

简介
迄今为止,基因表达谱分析是RNA-Seq在生物医学研究和诊断中最常用的应用。传统的基因表达项目使用mRNA测序技术,可以对全长转录本进行单核苷水平的全面解析,但对样品处理数量有限,成本高。尽管测序的价格在持续下降,样品制备、测序和数据处理仍然是限制高通量筛选的主要成本因素。

3’ mRNA-Seq 是基因表达谱分析的强有力工具
3’mRNA-Seq方法生成的NGS文库插入片段为多聚腺苷酸RNAs的3端,无需事先进行poly(A)富集处理(表1)。
表1丨常规mRNA-Seq和QuantSeq 3' mRNA -Seq基因表达谱分析方案比较。

*文库制备的总体时间,不包括QC

由于3' mRNA-seq每个转录本只产生一个文库片段,比对到给定基因的reads与其表达量成正比。3' mRNA-Seq不依赖于正确的异构体(isoform)注释和鉴定来确定确切基因表达值。此外,3' mRNA-Seq对RNA质量的差异不敏感。另一方面,传统的mRNA-seq需要高质量的RNA来富集mRNA,且对更长的转录本有偏好性,因为这些转录本产生更多的片段。因此,无论转录本长度如何,3' mRNA-Seq为基因表达谱提供了一个可靠且经济的解决方案1
QuantSeq-Pool 加快基因表达项目研究
Lexogen QuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3' mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。

Figure 1 | 早期的样本条barcode标记允许在一个反应中批量处理96个样本。可通过384 UDI index最多处理至36864个样本。

在文库制备的初始步骤中,通过barcode进行样本标记,以支持后续单个标记样本的pooling。此外,在此步骤还引入了单分子标签(UMIs),可消除PCR扩增带来的偏好性。通过将多达96个样品合并到一个反应中,4.5小时即可完成文库制备。批处理通过减少处理时间和消除定量、质量控制及单个样品文库的等摩尔pooling需要,显著缩短了完整的RNA到测序的工作流程(图2)。
通量灵活,适用于大规模的通量项目
在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDI index,以获得更高的通量。

图2 | QuantSeq-Pool可使96个样本在约5.5小时内完成RNA-测序工作流程。在QuantSeq-Pool流程的初始步骤中,通过barcode进行样本标记,以支持多大96个样本的pooling,并在单个反应中进行后续文库生成和扩增步骤的批量处理。随后PCR,包含96个样品的文库纯化,从而减少了消除定量、质量控制(QC)及单个样品文库的等摩尔pooling需要,显著减少上机测序前的准备工作。

QuantSeq-Pool通量灵活,96种i1 sample-barcodes与384 UDIindex组合,结合**可用的一组384 udi,最可达36864个样本(表2)。因此,QuantSeq-Pool的三重-indexed文库(包含i1 sample-barcodes、UMI,12 nt UDIs及)非常适合大规模筛查项目和在NovaSeq上大规模混样测序。初始pooling工作流程的高效性使手工处理高通量项目成为可能,无需专门的自动化处理设备。如果需要,自动化友好地流程也可以适用于处理数以千计的样品。

表 2 | QuantSeq-Pool 可处理高达36864个样本

稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度
高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100 K至1 M(图3)。
这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。
因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。

图3 | QuantSeq-Pool能够在低测序深度下实现稳定且一致的基因检测结果。以10 ng UHRR,用QuantSeq-Pool构建文库并测序,对每个样本以100 K、0.5 M和1 M reads数进行基因检测分析。基因检测的阈值为> 10 Counts Per Million (CPM)。

QuantSeq-Pool与Quantseq结果高度一致
QuantSeq-Pool可获得与Quantseq一致的结果,两者有良好相关性,且重复性好(图4)。轻微的差异主要体现在mt转录本上,这主要是由于Quantseq pool和Quangtseq操作流程上的差异导致,如对于低input,10 ng的RNA input量,Quantseq需要使用低input的操作流程。

图4 | QuantSeq-Pool与Quantseq结果高度一致,重复性好。

QuantSeq-Pool结合了样本barcode标记和早期pooling与3' mRNASeq的优点,是一种节省时间、测序数据量和数据分析工作的基因表达谱分析方法。
这意味着与传统的mRNA-Seq项目相比,总成本降低了10倍。input量通常可以低至10 ng总RNA,内置的UMIs可以消除PCR带来的偏好性,从而实现高度可信、稳定的基因表达分析。便捷的操作流程可以手动进行高通量量处理样本,而且对于需要大规模混样测序的项目也可用自动化操作流程。

订购信息:
货号:
139 (QuantSeq-Pool Sample-Barcoded 3’ mRNA-Seq Library Prep)
相关产品:
105 (Lexogen UDI 12 nt Set B1 (UDI12B_0001-0096))

说明书附件下载:

 Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒说明书-详细版-illumina平台