KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase

去核糖体全转录组KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase-Illumina平台

1、产品应用

●高质量和低质量的RNA样本（例如从FFPE组织提取的）基因表达分析。

●单核苷酸变异（SNV）的发现。

●剪接位点和融合基因的识别。

●不带poly尾的RNA的特性分析，包括非编码RNA和前提RNA。

2、产品优势

●高达99.98% rRNA去除效率　●起始总RNA范围为100ng～1μg

●适用物种为人、小鼠、大鼠　●不同起始量均能得到可靠的、可重复结果

●工作流程易于实现自动化，已有多种自动平台的对接方案。

3、优势表现

1）行业领先的rRNA去除效果

能从FFPE样本中有效去除rRNA

减少rRNA reads，测序更经济，转录本测序深度更深

2）**的覆盖均一性

●各转录本读序（read）分布均一

●5’-3’的偏好性小

3）无与伦比的测序数据质量

●检测更多基因和特定转录本

●准确、清晰地识别剪切位点和选择性剪切基因

●覆盖度高，能更好地检测困难或GC含量高的转录本

采用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase工作流程所取得的高质量测序数据，同Illumina、NEB相似试剂盒的对比结果；

KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase的工作流程不仅获得同类别试剂盒同等的测序读序映射率，同时重复率（duplication rates）低，覆盖均一性高，并且检测到更多数量的特异的转录片段和基因，从而使在样本中探测表达基因的灵敏度得到提高。

GC富集的转录片段的覆盖度提高：

上图显示haemoglobin alpha transcript(HBA1）的测序覆盖度和剪切位点识别情况.HBA1的GC含量为62.8%.图中显示GC含量的轨道行将GC含量高的区域标注为红色.AT含量高的区域标注成蓝色，经过KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase工作流程处理的样本（绿色），和与同类的Illumina试剂盒（橙色）或NEB试剂盒（蓝色）处理的样本相比，具有更均一的覆盖度，更灵敏的剪切位点识别，并且具有和未经rRNA处理样本（红色）相比更有代表性的数据图形样貌。

低丰度转录片段的检测率提高：

MALAT1，一个低丰度非编码RNA片段，在文库制备过程中运用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase（绿色）其片段序列和剪切位点均能够被均一的覆盖，相比之下，使用Illumina-ZeroGold（橙色）和NEBNext（蓝色）的工作流程所得到的该转录片段的覆盖度的均一性较低。

4）可高度重复的测序结果

●即使测试条件不同仍热有很高的相关性

●样本间差异小，结果可靠

重复样本之间基因表达水平的相关性：以上实验均使用100ng和UHR总RNA作为起始样本。使用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase的工作流程进行建库时，基因表达水品在重复样本之间显示出非常高的相关性（

R2>0.973）高于使用Illumina或NEB同类试剂盒进行建库的情形。

4、产品信息