环境微生物群落多样性
生物信息分析流程
研究内容 1. 数据统计分析 2. 数据根据Barcode信息回归样品 3. OTU(Operational Taxonomic Units)聚类 4. 稀释性曲线(Rarefaction Curve)
5. 分类学分析(Silva数据库) 6. 菌群多样性、丰度和测序深度指数计算 7. 多样品间两两sharedchao、sharedace指数计算 8. 组间显著性差异分析 9. 群落结构分析 图 3单样品群落结构饼图 图 4多样品群落结构柱状图 10. 分类学树状图 图 5单样品分类学树状图 图 6多样品分类学比对树状图
11. 多样品相似度比对 图 7 多样品相似度比对树状图 图 8 多样品相似度比对heatmap图
12. 样品OTU分布比较
13. PCA(Principal component analysis)分析
14. Weighted and unweighted unifrac PCA分析
文章分类:
META分析
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