Agilent全基因组表达谱芯片

      Agilent人类表达谱芯片参加了美国FDA组织实施的MAQC计划，系列指标表现突出，综合性能**，展示了其喷墨原位合成技术的实力。除了基于该技术的多物种的成品芯片外，Agilent着力发展个性化解决方案，利用其e-Array设计软件，可以灵活迅速地根据客户要求为客户设计制作各种芯片产品。

Agilent 芯片特点

·   独特的喷墨原位合成技术；

·   探针长度60mer，可以兼顾灵敏性和特异性，使二者达到良好的平衡；

·   由于采取长探针设计，有利于捕捉对生命活动有重要意义的低丰度基因；

·   芯片随数据库及时更新，基因信息更新更全，可最早升级到最新芯片版本；

·   灵活的定制方案，仅需基因组或EST序列，客户即可任意制作自己的芯片；

·   平均CV＜10%（MAQC：Nature Biotechnology Sept，2006）；

·   芯片具有良好的可重复性，相关系数R2＞0.95（MAQC）；

·   芯片数据结果与qPCR数据结果具有良好的相关性，相关系数R2＞0.9（MAQC ）。

Agilent表达谱芯片种类

Agilent芯片检测流程

芯片分析流程

芯片名称：Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K v2 Microarray NEW！

芯片介绍：安捷伦基于G3平台最新设计的人类表达谱芯片，将编码和非编码RNA整合在单张芯片上。除检测30,000条Entrez Gene RNAs外，还涵盖了12,000条lincRNAs。该芯片可同时检测蛋白编码RNA和非编码RNA的表达量变化。通过分析二者之间的相互关系，有助于预测lincRNA生物学功能。探针设计参照的数据库为：RefSeqBuild36.3；EnsembleRelease 52；Unigene Build 216；GenBank (April 2009)。lincRNA探针是Agilent和John Rinn 实验室（麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所）共同设计的。

芯片名称：Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K Microarray

芯片介绍：Agilent的人全基因组表达谱芯片，检测同时编码和非编码RNA，涵盖27,958条Entrez GeneRNA和7,419l条LincRNAs。设计该产品所用的序列信息源于对RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene等知名数据库的深入研究，并与人类基因组拼接进行比对。绝大多数探针经过Agilent专利的实验验证程序的检验和优化。

芯片名称：Agilent Whole Human Genome Gene Expression 4x44K v2 Microarray

芯片介绍：Agilent的人全基因组表达谱芯片，包含27,958条EntrezGeneRNA。序列信息源于：RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene 。